質(zhì)譜儀是一種很好的定性鑒定用儀器，目前，在有機質(zhì)譜儀中，除激光解吸電離-飛行時間質(zhì)譜儀和傅立葉變換質(zhì)譜儀之外，所有質(zhì)譜儀都是和氣相色譜或液相色譜組成聯(lián)用儀器。這樣，使質(zhì)譜儀無論在定性分析還是在定量分析方面都十分方便。
同時，為了增加未知物分析的結(jié)構(gòu)信息，為了增加分析的選擇性，采用串聯(lián)質(zhì)譜法(質(zhì)譜-質(zhì)譜聯(lián)用)，也是目前質(zhì)譜儀發(fā)展的一個方向。也就是說，目前的質(zhì)譜儀是以各種各樣的聯(lián)用方式工作的。
質(zhì)量分析器種類很多，最常用的是四極桿分析器(簡寫為Q)，其次是離子阱分析器(Trap)和飛行時間分析器(TOF)。為了增加結(jié)構(gòu)信息，大多采用具有串聯(lián)質(zhì)譜功能的質(zhì)量分析器,串聯(lián)方式很多，如Q-Q-Q，Q-TOF等。
一、十種質(zhì)譜的比較
（一）四極桿質(zhì)譜儀，QMS
QMS是最常見的質(zhì)譜儀器，定量能力突出，在GC-MS中QMS占絕大多數(shù)。
優(yōu)點：結(jié)構(gòu)簡單、成本低；維護簡單；SIM功能的定量能力強；是多數(shù)檢測標準中采用的儀器設(shè)備。
缺點：無串極能力，定性能力不足；分辨力較低(單位分辨)，存在同位素和其他m/z近似的離子干擾；速度慢；質(zhì)量上限低(小于1200u)。
（二）飛行時間質(zhì)譜儀，TOFMS
TOFMS是速度最快的質(zhì)譜儀，適合于LC-MS方面的應(yīng)用。
優(yōu)點：分辨能力好，有助于定性和m/z近似離子的區(qū)別，能夠很好的檢測ESI電噴霧離子源產(chǎn)生多電荷離子；速度快，每秒2～100張高分辨全掃描(如50～2000u)譜圖，適合于快速LC系統(tǒng)(如UPLC)；質(zhì)量上限高(6000～10000u)；
缺點：無串極功能，限制了進一步的定性能力；售價高于QMS；較精密，需要認真維護。
（三）三重四極桿質(zhì)譜儀，QQQ
QQQ質(zhì)譜給四極桿質(zhì)譜儀在保留QMS原有定量能力強的特點上，提供了串級功能，加強了質(zhì)譜的定性能力，檢測標準中常作為QMS的確認檢測手段。
優(yōu)點：有串極功能，定性能力強；定量能力非常好，MRM信噪比高于QMS的SIM；是常用的QMS結(jié)果確認儀器；除一般子離子掃描功能外，QQQ還具有SRM、MRM、母離子掃描、中性丟失(Neutral loss)等功能(離子阱不行)對特征基團的結(jié)構(gòu)研究有很大幫助。
缺點：分辨力不足，容易受m/z近似的離子干擾；售價較高；需要認真維護。
（四）四極離子阱，QTrap
技術(shù)上而言，在傳統(tǒng)QQQ的四極桿中加入了輔助射頻，可以做選擇性激發(fā)；或者就功能而言，為QQQ提供了多級串級的功能。
優(yōu)點：同時具備MRM、SRM、中性丟失和多級串級功能，非常適合于未知樣品的結(jié)構(gòu)解析。
缺點：分辨力還是低了點。
（五）線性離子阱，Linear Ion Trap
傳統(tǒng)3D離子阱的增強版本。
優(yōu)點：相對于傳統(tǒng)3D離子阱，靈敏度高10倍以上；多級串級質(zhì)譜。
缺點：相對于QQQ，還是不能做MRM、中性丟失等特征基團篩選功能。
（六）四極桿飛行時間串聯(lián)質(zhì)譜，QTOF
QTOF以QMS作為質(zhì)量過濾器，以TOFMS作為質(zhì)量分析器。
優(yōu)點：能夠提供高分辨譜圖；定性能力好于QQQ；速度快，適合于生命科學(xué)的大分子量復(fù)雜樣品分析。
缺點：成本高；需要仔細維護。
（七）離子阱-飛行時間質(zhì)譜，Trap TOF
以3D離子阱作為質(zhì)量選擇器和反應(yīng)器，結(jié)合了離子阱的多級質(zhì)譜能力和飛行時間質(zhì)譜的高分辨能力。
優(yōu)點：同時具有多級串級和高分辨能力，適合于未知樣品的定性工作，如糖蛋白的定性。
缺點：由于離子阱容量限制，對于混合樣品的靈敏度欠佳；定量能力弱。
（八）磁質(zhì)譜，Sector MS
磁質(zhì)譜的定量能力是各種質(zhì)譜中最強的?，F(xiàn)在已較少使用，僅用于地質(zhì)元素和痕量二惡英的檢測。
優(yōu)點：技術(shù)經(jīng)典、成熟，NIST等MS庫采用的儀器；分辨力非常好(100k，m/&Delta m FWHM)，干擾少；靈敏度高，定量能力是各種質(zhì)譜中最好的。
缺點：體積、重量大；售價很高；速度慢；維護復(fù)雜，很費電。
（九）傅立葉變換質(zhì)譜儀，FT-ICR-MS
據(jù)說是質(zhì)譜中的貴族，質(zhì)量精度超級好，幾個月都不需要校正。但是價格也是貴的讓人心寒啊。傅立葉變換質(zhì)譜儀的分辨能力最高，常作為高端科學(xué)研究的裝備。
優(yōu)點：能夠做多級串級，定性能力極好；分辨力極高；靈敏度很好；
缺點：體積重量大；售價極高；速度也較慢；維護費用非常昂貴。
（十）靜電場傅立葉變換質(zhì)譜，Orbitrap
優(yōu)點：高分辨，60k～120kFWHM，質(zhì)量精度高；相對FT-ICR而言，價格稍低(～450kUSD)；
缺點：不能單獨做串級；分辨力、靈敏度、質(zhì)量穩(wěn)定性等離FT-ICR還有距離。
目前，質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)已經(jīng)非常成熟，憑借其應(yīng)用范圍廣、靈敏度高、分析速度快、信息量大、重現(xiàn)性好等特點被廣泛應(yīng)用于食品、藥學(xué)、環(huán)境等領(lǐng)域。
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